万方在线查重原理是基于文本比对技术，通过对上传的文档与万方数据库中已有的文献进行比对，找出文档中与已有文献相似的部分，从而判断文档的原创性。具体来说，万方在线查重采用了基于词语、短语、句子、段落、篇章等多层次的文本相似度比对算法，结合大规模的文献数据库，能够快速、准确地检测出文档中的抄袭部分。

使用万方在线查重的方法首先是注册登录万方网站，然后选择查重工具，上传需要检测的文档，系统会自动进行比对分析，最终生成查重报告。在使用时需要注意，为了提高查重的准确性，上传的文档应尽量完整，避免过短的文本或者图片文档，同时也要注意文档格式的兼容性，以保证查重结果的准确性。